Mulți contribuabili au observat discrepanțe între sumele facturilor în format fizic și cele din e-Factura. Sistemul MF rotunjeste incorect sumele la ultimele două zecimale, transformând cifrele 9 în 0.
Lipsa unei funcții de descărcare directă a facturilor în format PDF (recent introdusă), dispariția facturilor din sistem după 60 de zile, obligând contribuabilii să solicite recuperarea lor de la ANAF, lipsa funcțiilor de căutare avansată a facturilor în baza de date e-Factura, bazându-se doar pe indexul de încărcare, sunt doar câteva dintre probleme semnalate, notează HotNews.